Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Necab3Q9D6J4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Necab3Q9D6J4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Necab3Q9D6J4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms