Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc81Q9D5W4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc81Q9D5W4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc81Q9D5W4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc81Q9D5W4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc81Q9D5W4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc81Q9D5W4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc81Q9D5W4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc81Q9D5W4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc81Q9D5W4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc81Q9D5W4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc81Q9D5W4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc81Q9D5W4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc81Q9D5W4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc81Q9D5W4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc81Q9D5W4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc81Q9D5W4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc81Q9D5W4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc81Q9D5W4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc81Q9D5W4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc81Q9D5W4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc81Q9D5W4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc81Q9D5W4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms