Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam227bQ9D518 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam227bQ9D518 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam227bQ9D518 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam227bQ9D518 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam227bQ9D518 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam227bQ9D518 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam227bQ9D518 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam227bQ9D518 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam227bQ9D518 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam227bQ9D518 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam227bQ9D518 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam227bQ9D518 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam227bQ9D518 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam227bQ9D518 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam227bQ9D518 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam227bQ9D518 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam227bQ9D518 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam227bQ9D518 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam227bQ9D518 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam227bQ9D518 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam227bQ9D518 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam227bQ9D518 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam227bQ9D518 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam227bQ9D518 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam227bQ9D518 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam227bQ9D518 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam227bQ9D518 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam227bQ9D518 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms