Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc83Q9D4V3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc83Q9D4V3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc83Q9D4V3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc83Q9D4V3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc83Q9D4V3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc83Q9D4V3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc83Q9D4V3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc83Q9D4V3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc83Q9D4V3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc83Q9D4V3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc83Q9D4V3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc83Q9D4V3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc83Q9D4V3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc83Q9D4V3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc83Q9D4V3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc83Q9D4V3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc83Q9D4V3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc83Q9D4V3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc83Q9D4V3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms