Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930564D02RikQ9D4S4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930564D02RikQ9D4S4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms