Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phf6Q9D4J7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phf6Q9D4J7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms