Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syf2Q9D198 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syf2Q9D198 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Syf2Q9D198 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Syf2Q9D198 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Syf2Q9D198 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syf2Q9D198 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syf2Q9D198 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syf2Q9D198 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syf2Q9D198 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syf2Q9D198 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syf2Q9D198 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syf2Q9D198 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syf2Q9D198 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syf2Q9D198 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syf2Q9D198 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syf2Q9D198 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syf2Q9D198 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syf2Q9D198 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syf2Q9D198 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syf2Q9D198 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syf2Q9D198 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syf2Q9D198 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syf2Q9D198 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syf2Q9D198 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syf2Q9D198 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syf2Q9D198 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Syf2Q9D198 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms