Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdca7Q9D0M2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdca7Q9D0M2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms