Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndc80Q9D0F1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndc80Q9D0F1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ndc80Q9D0F1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ndc80Q9D0F1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Ndc80Q9D0F1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndc80Q9D0F1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndc80Q9D0F1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndc80Q9D0F1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndc80Q9D0F1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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