Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXB8

Alpk1, Alpha-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk1Q9CXB8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Alpk1Q9CXB8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Alpk1Q9CXB8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Alpk1Q9CXB8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Alpk1Q9CXB8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Alpk1Q9CXB8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Alpk1Q9CXB8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Alpk1Q9CXB8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Alpk1Q9CXB8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Alpk1Q9CXB8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Alpk1Q9CXB8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Alpk1Q9CXB8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Alpk1Q9CXB8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Alpk1Q9CXB8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Alpk1Q9CXB8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Alpk1Q9CXB8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Alpk1Q9CXB8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Alpk1Q9CXB8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Alpk1Q9CXB8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Alpk1Q9CXB8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Alpk1Q9CXB8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Alpk1Q9CXB8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Alpk1Q9CXB8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Alpk1Q9CXB8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Alpk1Q9CXB8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Alpk1Q9CXB8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Alpk1Q9CXB8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Alpk1Q9CXB8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Alpk1Q9CXB8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Alpk1Q9CXB8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Alpk1Q9CXB8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Alpk1Q9CXB8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Alpk1Q9CXB8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Alpk1Q9CXB8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Alpk1Q9CXB8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Alpk1Q9CXB8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Alpk1Q9CXB8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Alpk1Q9CXB8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.3 ms