Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Atxn3Q9CVD2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atxn3Q9CVD2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atxn3Q9CVD2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atxn3Q9CVD2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atxn3Q9CVD2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Atxn3Q9CVD2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atxn3Q9CVD2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atxn3Q9CVD2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atxn3Q9CVD2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atxn3Q9CVD2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atxn3Q9CVD2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atxn3Q9CVD2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atxn3Q9CVD2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atxn3Q9CVD2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atxn3Q9CVD2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atxn3Q9CVD2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atxn3Q9CVD2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atxn3Q9CVD2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atxn3Q9CVD2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atxn3Q9CVD2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atxn3Q9CVD2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atxn3Q9CVD2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atxn3Q9CVD2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Atxn3Q9CVD2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Atxn3Q9CVD2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atxn3Q9CVD2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms