Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700029F12RikQ9CRB4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700029F12RikQ9CRB4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700029F12RikQ9CRB4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms