Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc43Q9CR29 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc43Q9CR29 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms