Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rwdd1Q9CQK7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rwdd1Q9CQK7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rwdd1Q9CQK7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rwdd1Q9CQK7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rwdd1Q9CQK7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rwdd1Q9CQK7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rwdd1Q9CQK7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rwdd1Q9CQK7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rwdd1Q9CQK7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rwdd1Q9CQK7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rwdd1Q9CQK7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rwdd1Q9CQK7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rwdd1Q9CQK7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rwdd1Q9CQK7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rwdd1Q9CQK7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rwdd1Q9CQK7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rwdd1Q9CQK7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rwdd1Q9CQK7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rwdd1Q9CQK7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rwdd1Q9CQK7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rwdd1Q9CQK7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rwdd1Q9CQK7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rwdd1Q9CQK7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rwdd1Q9CQK7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rwdd1Q9CQK7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rwdd1Q9CQK7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rwdd1Q9CQK7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms