Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ndufb9Q9CQJ8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ndufb9Q9CQJ8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ndufb9Q9CQJ8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms