Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ89

Cuta, Protein CutA, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CutaQ9CQ89 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CutaQ9CQ89 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CutaQ9CQ89 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CutaQ9CQ89 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CutaQ9CQ89 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CutaQ9CQ89 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CutaQ9CQ89 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CutaQ9CQ89 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CutaQ9CQ89 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CutaQ9CQ89 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CutaQ9CQ89 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CutaQ9CQ89 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CutaQ9CQ89 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CutaQ9CQ89 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CutaQ9CQ89 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CutaQ9CQ89 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CutaQ9CQ89 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CutaQ9CQ89 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CutaQ9CQ89 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CutaQ9CQ89 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CutaQ9CQ89 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CutaQ9CQ89 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CutaQ9CQ89 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CutaQ9CQ89 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CutaQ9CQ89 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CutaQ9CQ89 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CutaQ9CQ89 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CutaQ9CQ89 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CutaQ9CQ89 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CutaQ9CQ89 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CutaQ9CQ89 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CutaQ9CQ89 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CutaQ9CQ89 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CutaQ9CQ89 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms