Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pkp2Q9CQ73 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pkp2Q9CQ73 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkp2Q9CQ73 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms