Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM15Q9C019 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM15Q9C019 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms