Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC94Q9BW85 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC94Q9BW85 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC94Q9BW85 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms