Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRNP25Q9BV90 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRNP25Q9BV90 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRNP25Q9BV90 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRNP25Q9BV90 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRNP25Q9BV90 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRNP25Q9BV90 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRNP25Q9BV90 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRNP25Q9BV90 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRNP25Q9BV90 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRNP25Q9BV90 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRNP25Q9BV90 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNRNP25Q9BV90 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 592.9 ms