Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV35

SLC25A23, Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-3, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A23Q9BV35 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A23Q9BV35 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A23Q9BV35 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC25A23Q9BV35 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms