Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSEN34Q9BSV6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
TSEN34Q9BSV6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSEN34Q9BSV6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSEN34Q9BSV6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms