Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TIMM29Q9BSF4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMM29Q9BSF4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms