Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MXRA8Q9BRK3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MXRA8Q9BRK3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MXRA8Q9BRK3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.4 ms