Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Prpf8Q99PV0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf8Q99PV0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms