Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GpnmbQ99P91 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GpnmbQ99P91 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GpnmbQ99P91 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GpnmbQ99P91 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GpnmbQ99P91 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GpnmbQ99P91 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GpnmbQ99P91 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GpnmbQ99P91 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GpnmbQ99P91 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GpnmbQ99P91 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GpnmbQ99P91 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GpnmbQ99P91 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GpnmbQ99P91 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GpnmbQ99P91 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GpnmbQ99P91 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GpnmbQ99P91 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GpnmbQ99P91 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GpnmbQ99P91 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.7 ms