Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Nup155Q99P88 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Nup155Q99P88 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Nup155Q99P88 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Nup155Q99P88 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Nup155Q99P88 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Nup155Q99P88 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Nup155Q99P88 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Nup155Q99P88 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Nup155Q99P88 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Nup155Q99P88 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Nup155Q99P88 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Nup155Q99P88 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Nup155Q99P88 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Nup155Q99P88 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Nup155Q99P88 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Nup155Q99P88 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Nup155Q99P88 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Nup155Q99P88 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Nup155Q99P88 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Nup155Q99P88 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Nup155Q99P88 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Nup155Q99P88 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Nup155Q99P88 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Nup155Q99P88 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Nup155Q99P88 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Nup155Q99P88 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Nup155Q99P88 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Nup155Q99P88 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Nup155Q99P88 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Nup155Q99P88 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Nup155Q99P88 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nup155Q99P88 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nup155Q99P88 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nup155Q99P88 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nup155Q99P88 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nup155Q99P88 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nup155Q99P88 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nup155Q99P88 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nup155Q99P88 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nup155Q99P88 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Nup155Q99P88 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Nup155Q99P88 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Nup155Q99P88 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Nup155Q99P88 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Nup155Q99P88 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Nup155Q99P88 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Nup155Q99P88 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Nup155Q99P88 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Nup155Q99P88 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Nup155Q99P88 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Nup155Q99P88 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Nup155Q99P88 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Nup155Q99P88 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Nup155Q99P88 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nup155Q99P88 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nup155Q99P88 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nup155Q99P88 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nup155Q99P88 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Nup155Q99P88 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Nup155Q99P88 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Nup155Q99P88 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Nup155Q99P88 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Nup155Q99P88 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Nup155Q99P88 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Nup155Q99P88 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Nup155Q99P88 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Nup155Q99P88 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Nup155Q99P88 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Nup155Q99P88 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Nup155Q99P88 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Nup155Q99P88 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Nup155Q99P88 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms