Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bco2Q99NF1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bco2Q99NF1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bco2Q99NF1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Bco2Q99NF1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
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