Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vgll1Q99NC0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vgll1Q99NC0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vgll1Q99NC0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms