Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.57
Pcgf6Q99NA9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
Pcgf6Q99NA9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Pcgf6Q99NA9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Pcgf6Q99NA9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Pcgf6Q99NA9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Pcgf6Q99NA9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Pcgf6Q99NA9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Pcgf6Q99NA9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Pcgf6Q99NA9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Pcgf6Q99NA9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Pcgf6Q99NA9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Pcgf6Q99NA9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Pcgf6Q99NA9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Pcgf6Q99NA9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Pcgf6Q99NA9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Pcgf6Q99NA9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Pcgf6Q99NA9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Pcgf6Q99NA9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Pcgf6Q99NA9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Pcgf6Q99NA9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.3 ms