Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tdrd1Q99MV1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd1Q99MV1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tdrd1Q99MV1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tdrd1Q99MV1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms