Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tpgs1Q99MS8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpgs1Q99MS8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpgs1Q99MS8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms