Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR9

Ppp1r3a, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3aQ99MR9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppp1r3aQ99MR9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppp1r3aQ99MR9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r3aQ99MR9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms