Protein–RNA interactions for Protein: Q99MJ9

Ddx50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx50Q99MJ9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx50Q99MJ9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ddx50Q99MJ9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx50Q99MJ9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms