Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Atp1b4Q99ME6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Atp1b4Q99ME6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Atp1b4Q99ME6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Atp1b4Q99ME6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Atp1b4Q99ME6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Atp1b4Q99ME6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Atp1b4Q99ME6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Atp1b4Q99ME6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Atp1b4Q99ME6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Atp1b4Q99ME6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Atp1b4Q99ME6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Atp1b4Q99ME6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Atp1b4Q99ME6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Atp1b4Q99ME6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Atp1b4Q99ME6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Atp1b4Q99ME6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Atp1b4Q99ME6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Atp1b4Q99ME6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Atp1b4Q99ME6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Atp1b4Q99ME6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Atp1b4Q99ME6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Atp1b4Q99ME6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Atp1b4Q99ME6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Atp1b4Q99ME6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Atp1b4Q99ME6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Atp1b4Q99ME6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Atp1b4Q99ME6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Atp1b4Q99ME6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Atp1b4Q99ME6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Atp1b4Q99ME6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Atp1b4Q99ME6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Atp1b4Q99ME6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Atp1b4Q99ME6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Atp1b4Q99ME6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Atp1b4Q99ME6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Atp1b4Q99ME6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Atp1b4Q99ME6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Atp1b4Q99ME6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Atp1b4Q99ME6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Atp1b4Q99ME6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Atp1b4Q99ME6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Atp1b4Q99ME6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Atp1b4Q99ME6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Atp1b4Q99ME6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Atp1b4Q99ME6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Atp1b4Q99ME6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Atp1b4Q99ME6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Atp1b4Q99ME6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Atp1b4Q99ME6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Atp1b4Q99ME6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Atp1b4Q99ME6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Atp1b4Q99ME6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Atp1b4Q99ME6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Atp1b4Q99ME6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Atp1b4Q99ME6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Atp1b4Q99ME6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Atp1b4Q99ME6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Atp1b4Q99ME6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Atp1b4Q99ME6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Atp1b4Q99ME6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Atp1b4Q99ME6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Atp1b4Q99ME6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Atp1b4Q99ME6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Atp1b4Q99ME6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Atp1b4Q99ME6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Atp1b4Q99ME6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Atp1b4Q99ME6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Atp1b4Q99ME6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.1 ms