Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ciao1Q99KN2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ciao1Q99KN2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ciao1Q99KN2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms