Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdcbp2Q99JZ0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sdcbp2Q99JZ0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdcbp2Q99JZ0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sdcbp2Q99JZ0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdcbp2Q99JZ0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdcbp2Q99JZ0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms