Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3CQ99985 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3CQ99985 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms