Protein–RNA interactions for Protein: Q99835

SMO, Smoothened homolog, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOQ99835 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMOQ99835 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMOQ99835 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMOQ99835 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMOQ99835 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMOQ99835 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMOQ99835 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMOQ99835 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMOQ99835 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMOQ99835 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMOQ99835 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMOQ99835 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMOQ99835 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMOQ99835 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMOQ99835 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMOQ99835 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMOQ99835 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMOQ99835 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMOQ99835 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMOQ99835 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMOQ99835 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMOQ99835 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMOQ99835 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMOQ99835 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMOQ99835 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMOQ99835 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMOQ99835 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMOQ99835 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMOQ99835 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMOQ99835 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMOQ99835 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMOQ99835 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMOQ99835 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMOQ99835 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMOQ99835 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMOQ99835 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMOQ99835 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMOQ99835 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMOQ99835 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMOQ99835 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMOQ99835 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMOQ99835 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMOQ99835 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMOQ99835 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SMOQ99835 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMOQ99835 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMOQ99835 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMOQ99835 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMOQ99835 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMOQ99835 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMOQ99835 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMOQ99835 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMOQ99835 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMOQ99835 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMOQ99835 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMOQ99835 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMOQ99835 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMOQ99835 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMOQ99835 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMOQ99835 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMOQ99835 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMOQ99835 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMOQ99835 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMOQ99835 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMOQ99835 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMOQ99835 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMOQ99835 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMOQ99835 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMOQ99835 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMOQ99835 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMOQ99835 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMOQ99835 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMOQ99835 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMOQ99835 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMOQ99835 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMOQ99835 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SMOQ99835 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SMOQ99835 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMOQ99835 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMOQ99835 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMOQ99835 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMOQ99835 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMOQ99835 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMOQ99835 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMOQ99835 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMOQ99835 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMOQ99835 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMOQ99835 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMOQ99835 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMOQ99835 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMOQ99835 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMOQ99835 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMOQ99835 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMOQ99835 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMOQ99835 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SMOQ99835 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMOQ99835 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMOQ99835 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMOQ99835 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMOQ99835 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms