Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PIK3R4Q99570 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PIK3R4Q99570 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PIK3R4Q99570 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
PIK3R4Q99570 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
PIK3R4Q99570 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PIK3R4Q99570 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PIK3R4Q99570 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PIK3R4Q99570 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PIK3R4Q99570 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PIK3R4Q99570 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PIK3R4Q99570 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PIK3R4Q99570 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PIK3R4Q99570 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PIK3R4Q99570 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PIK3R4Q99570 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PIK3R4Q99570 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PIK3R4Q99570 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PIK3R4Q99570 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PIK3R4Q99570 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PIK3R4Q99570 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PIK3R4Q99570 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PIK3R4Q99570 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PIK3R4Q99570 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms