Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCNAQ96QF7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCNAQ96QF7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCNAQ96QF7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCNAQ96QF7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms