Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEPDC7Q96QD5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEPDC7Q96QD5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DEPDC7Q96QD5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEPDC7Q96QD5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms