Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCLT1Q96NL6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCLT1Q96NL6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCLT1Q96NL6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms