Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEUROD6Q96NK8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEUROD6Q96NK8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NEUROD6Q96NK8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms