Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC43Q96MW1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC43Q96MW1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC43Q96MW1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC43Q96MW1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC43Q96MW1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC43Q96MW1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC43Q96MW1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC43Q96MW1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC43Q96MW1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC43Q96MW1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC43Q96MW1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC43Q96MW1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC43Q96MW1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC43Q96MW1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC43Q96MW1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC43Q96MW1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC43Q96MW1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC43Q96MW1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC43Q96MW1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC43Q96MW1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC43Q96MW1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC43Q96MW1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC43Q96MW1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms