Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF7

SMIM8, Small integral membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM8Q96KF7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM8Q96KF7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms