Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CELF6Q96J87 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CELF6Q96J87 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 313.7 ms