Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC11Q96J66 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC11Q96J66 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC11Q96J66 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC11Q96J66 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC11Q96J66 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC11Q96J66 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC11Q96J66 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ABCC11Q96J66 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ABCC11Q96J66 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ABCC11Q96J66 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ABCC11Q96J66 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ABCC11Q96J66 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCC11Q96J66 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCC11Q96J66 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCC11Q96J66 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCC11Q96J66 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCC11Q96J66 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ABCC11Q96J66 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCC11Q96J66 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ABCC11Q96J66 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
ABCC11Q96J66 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
ABCC11Q96J66 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ABCC11Q96J66 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC11Q96J66 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC11Q96J66 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
ABCC11Q96J66 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ABCC11Q96J66 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ABCC11Q96J66 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ABCC11Q96J66 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ABCC11Q96J66 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.8■■■■□ 3
ABCC11Q96J66 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ABCC11Q96J66 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC11Q96J66 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC11Q96J66 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC11Q96J66 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC11Q96J66 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC11Q96J66 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC11Q96J66 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC11Q96J66 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC11Q96J66 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.77■■■■□ 3
ABCC11Q96J66 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ABCC11Q96J66 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC11Q96J66 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC11Q96J66 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.98
ABCC11Q96J66 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
ABCC11Q96J66 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC11Q96J66 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC11Q96J66 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC11Q96J66 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCC11Q96J66 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCC11Q96J66 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCC11Q96J66 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCC11Q96J66 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCC11Q96J66 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC11Q96J66 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC11Q96J66 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC11Q96J66 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC11Q96J66 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC11Q96J66 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC11Q96J66 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC11Q96J66 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC11Q96J66 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC11Q96J66 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC11Q96J66 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC11Q96J66 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC11Q96J66 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC11Q96J66 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC11Q96J66 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms