Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MS4A3Q96HJ5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms