Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC35A4Q96G79 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC35A4Q96G79 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35A4Q96G79 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms